我最近做了我的目的基因的干扰（knockdown，KD），qpcr检测发现敲低效果非常好，但为啥WB检测蛋白变化不明显呢？

根据我的经验来说，我觉得有以下几个原因可参考：
①有些蛋白半衰期长，即使干扰也不一定能被很快降低，可以检测不同时间的比较看看；
②部分蛋白在胞内的翻译有一定效率，干扰降低mRNA，细胞可能进一步提高翻译的效率，导致蛋白受到的影响没有mRNA那么直接；
③蛋白在胞内有一定的代谢率，且是可变的，当表达减少，胞内蛋白降解效率也可能反向调节。