小恒学术问答 » 落落
落落

用户名:落落

注册于:2023-03-28

主题数: 33     回贴数: 28

网站:

介绍:

最后活动于11 小时前
创建了主题  › 用腺相关病毒(adeno-associated virus,AAV)感染心脏,感染完之后还要做组织免疫荧光(红绿光)染其他指标,怎么选择AAV的荧光呢?

用腺相关病毒(adeno-associated virus,AAV)感染心脏,感染完之后还要做组织免疫荧光(红绿光)染其他指标,怎么选择AAV的荧光呢?

«  11 小时前
创建了主题  › 过表达慢病毒效果检测(qPCR、WB)

想请教下做慢病毒(LV,lentivirus)过表达WB一直没有条带是什么原因?看荧光感染效率有80%以上,qPCR结果也不错,感染72h后做WB,目的抗体检测没有条带,空白、对照和目的组都没有,是上样量太少了吗?

«  11 小时前
回复了主题  › 载体选择

最好是带特异性启动子,AAV病毒(Adeno-associated virus)选择尾静脉注射,如果是广谱启动子一般也会感染到其他脏器。目前用得比较多的肝脏特异性启动子是TBG,可以试试

«  7 天前
回复了主题  › 腺病毒构建!

没有要求,一般建议结合自己的实验进行选择。比如说如果后续要做免疫荧光这类的实验,或者要共转其他带荧光的质粒,前期选择荧光标签就要考虑避开

«  7 天前
创建了主题  › 从floxp小鼠分离出来的原代细胞,用携带Cre的腺病毒(Adenovirus,AdV)进行感染,但敲除结果非常不理想且不稳定,这种结果的可能原因和解决方案有哪些?

从floxp小鼠分离出来的原代细胞,用携带Cre的腺病毒(Adenovirus,AdV)进行感染,但敲除结果非常不理想且不稳定,这种结果的可能原因和解决方案有哪些?

«  7 天前
创建了主题  › 请问不同网站启动子序列差很多正常吗?我根据网上教程用ncbi和ucsc都试了下,发现两个序列差了快400bp,ncbi是序列往前推了2000bp,ucsc是取了上游2000bp。

请问不同网站启动子序列差很多正常吗?我根据网上教程用ncbi和ucsc都试了下,发现两个序列差了快400bp,ncbi是序列往前推了2000bp,ucsc是取了上游2000bp。

«  7 天前
创建了主题  › 我想研究一个基因,但在ncbi上查发现有好多转录本,怎么选择研究的转录本呢?

我想研究一个基因,但在ncbi上查发现有好多转录本,怎么选择研究的转录本呢?

«  7 天前
创建了主题  › 感染了慢病毒(Lentivirus,LV)后分选出来培养的细胞中,在后续传代培养过程中新长出来的细胞会有不带荧光的情况吗?如果会有这种情况怎么继续维持阳性率呢?

感染了慢病毒(Lentivirus,LV)后分选出来培养的细胞中,在后续传代培养过程中新长出来的细胞会有不带荧光的情况吗?如果会有这种情况怎么继续维持阳性率呢?

«  7 天前
回复了主题  › 悬浮细胞做慢病毒(Lentivirus, LV)感染,用24孔板做,初始的接种细胞量一般怎么确定?

可以参考贴壁细胞的接种数量做。一般做慢病毒感染的细胞接种初始数量可以根据细胞的生长速度决定,以48-72h内达到传代标准接种,理论上来说到48h后基本就可以用药进行筛选了,个人经验,仅供参考。

«  25 天前
回复了主题  › siRNA干扰后(RNAi),目的基因在mRNA水平出现显著下调,但在蛋白水平做WB实验有时能做出轻微变化,有时就感觉没有,这可能有哪些原因?

如果前期实验有出现过有下调趋势的结果,那最有可能的原因是目的蛋白本底比较高,mRNA的翻译效率比较好,这个程度的mRNA水平敲低映射到蛋白水平不明显,WB技术最终的定量本身就存在一定的误差,所以变化可能不明显。

«  25 天前
回复了主题  › 我做慢病毒(Lentivirus, LV)感染细胞,慢病毒带了绿色荧光,感染48h之后观察,特别亮的荧光很少,都是很淡的荧光,是不是亮的那种才是感染上了的?淡的不是?

可以和没有感染病毒的细胞对比下排除下自发荧光。不是自发荧光的话,亮的和淡的都是感染上了的,淡的就是进入细胞的慢病毒比较少,可以再摸索下合适的moi哦。

«  25 天前
«  25 天前
回复了主题  › siRNA可以打动物吗?我做基因干扰需要补实验,尾静脉注射小鼠,用siRNA是不是实验周期短一点?多久可以达到敲低效果?

可以是可以,小鼠系统注射一般是注射5-20nmol/20g,一周注射2-3次,连续2-4周,第一次注射后2-4周检测。不过还是建议用病毒哦,siRNA在体内不太稳定,容易分解。如果有现成的干扰腺病毒(Adenovirus,ADV)一周就可以检测了,腺相关病毒(adeno-associated virus,AAV)需要注射3周后检测。

«  2024-03-07
回复了主题  › 做细胞传代消化时间太长了,可能消化过度了,求问有什么补救措施?

可以用培养基中和。收集全部细胞到离心管中,1500rmp离心3min,弃上清用完全培养基重悬继续培养,状态不好的细胞在培养的过程中会死亡脱落,换液的时候可以去掉。

«  2024-03-07
创建了主题  › 基于Cre-loxp系统的DIO系统和FLEX系统有什么区别,如果有组织特异性Cre鼠,想在这一组织上特异性表达某个基因,是用哪一种?

基于Cre-loxp系统的DIO系统和FLEX系统有什么区别,如果有组织特异性Cre鼠,想在这一组织上特异性表达某个基因,是用哪一种?

«  2024-03-07
创建了主题  › 做敲低,用siRNA转染细胞有70%-80%的敲低效率,为什么同样的靶点做成shRNA慢病毒(Lentivirus)就检测不到干扰效果呢?

做敲低,用siRNA转染细胞有70%-80%的敲低效率,为什么同样的靶点做成shRNA慢病毒(Lentivirus)就检测不到干扰效果呢?

«  2024-03-07
回复了主题  › 脂质体转染细胞的时候为什么不能用含血清的培养基配制转染试剂?

因为血清中含有大量的蛋白质,带负电的蛋白质可能干扰阳离子脂质体/阳离子聚合物对核酸的吸附,最终影响转染效率。

«  2023-10-13
回复了主题  › 用Cas9和gRNA分开的慢病毒(Lentivirus)做敲除细胞系,两个病毒要怎么转染?怎么筛选?

建议两个慢病毒携带不同的抗性,先转cas9慢病毒,筛好稳转株之后再转gRNA慢病毒,再用另一种药物筛稳转就可以了。

«  2023-10-13
回复了主题  › 我想构建带绿色荧光的载体,看到文献有的带GFP,有的带EGFP,GFP和EGFP两种荧光蛋白有什么区别啊?哪个更好?

GFP(代表绿色荧光蛋白)是一种在暴露于蓝光时表现出明亮的绿色荧光的蛋白质,而EGFP(代表增强型绿色荧光蛋白)表现出比GFP更强的荧光。 此外,GFP和EGFP之间的另一个重要区别是GFP是从水母Aequorea victoria分离出来的野生型蛋白质。但是,EGFP是原始野生型的工程变体。GFP和EGFP是两种类型的蛋白质,用作内部发色团。它们不需要任何辅助酶/底物,辅因子或基因产物来展示其颜色。因此,两者都被用作分子生物学中基因表达的报告者。一般认为EGFP的荧光更强些。

«  2023-10-13
回复了主题  › 请问saCas9的gRNA筛选为什么比spCas9的更难?

这是因为saCas9识别的PAM序列要比spCas9的PAM序列长,在基因组中出现的概率更低,相比于spCas9脱靶率要低,其gRNA设计也相对更困难。

«  2023-10-13
«  2023-09-22
«  2023-09-22
回复了主题  › 如果想稳转两个基因到细胞里,有什么可行的方案吗?

可以将两个基因分别包成两个过表达慢病毒(Lentivirus)进行先后的分别感染与筛选,给两个慢病毒分别带上不同的抗性基因和荧光,先感染一个病毒进行筛选,成功之后,再进行下一个基因的感染与筛选,一般就可获得同时过表达两个基因的稳转细胞株。

«  2023-09-15
回复了主题  › 我看了篇大鼠同样基因的文献,里面筛选了一条90%以上干扰效率的靶点,这个基因的大鼠和小鼠CDS序列相似度很高,我可不可以直接用这个序列做小鼠基因的干扰?

不一定有效果。 首先,需要看大鼠干扰靶点序列是否与小鼠基因CDS序列完全匹配,不能完全匹配则干扰效果不佳或者无效果;其次,即使序列完全匹配,大鼠干扰靶点序列由于未经blast,在小鼠中可能会有脱靶效应。

«  2023-09-15