使用带有荧光标记的腺相关病毒(AAV)感染动物组织后,我做了组织石蜡切片,想通过荧光看下感染效率,可以直接观察吗?
我通过尾静脉注射AAV-F4/80感染小鼠心脏巨噬细胞,以在巨噬细胞中过表达目的基因,但取心脏组织做qPCR检测未看到目的基因的过表达是什么原因呢?
请问下,U6启动子启动转录序列的第一位必须是G吗?还有U6启动子的适用于哪些种属呢?
会有一定的影响,这个只能说在铺板的时候多吹吹,尽量把细胞吹开,尽量铺开
HepG2好像不太好做单克隆,要不就把sgrna设计在基因最前面几百bp,要不就做片段敲除,在基因左右两边设计sgrna,不过片段敲除的单克隆更难筛了。
肝脏本身是最容易被AAV感染的部位,可能是肌肉注射病毒进入循环系统了。
可以做一个药物梯度的预实验,如果每个浓度都出现细胞空泡,可能是细胞对puro比较敏感,病毒带荧光的话建议换成流式筛选。
可以检测病毒的元件或者是直接检测目的基因的dna,做QPCR检测
不一样的,VP指的是病毒颗粒数,包括了有感染能力的和无感染能力的,PFU测的是有感染能力的病毒数
我想请教一下miRNA的过表达可以用qPCR检测吗?miRNA序列太短了感觉不好设计引物。
腺相关病毒(AAV)感染小鼠成骨细胞,请问有没有合适的血清型或者启动子?
可能会比打成年小鼠影响大点,有些文章是50ul,试试25ul-50ul做个预实验就知道了。
特异启动子一般是二类启动子,这种启动子转录的RNA就会经历加工过程,不像U6那种3类RNA聚合酶专门转录短RNA,所有用2类启动子需要模拟miRNA的加工过程在shRNA上套个miRNA的加工框架,防止shRNA错误的表达
需要的,可以用RNA专用转染试剂,但是siRNA在体内维持时间很短,如果实验周期较长建议用病毒载体哦。
lncRNA 用慢病毒风险很大,慢病毒是RNA 病毒,lncRNA 的转录终止需要PolyA,而PolyA 会导致在包装过程中慢病毒基因组的表达提前终止,导致慢病毒包毒不成功。很多lncRNA 的PolyA 需要外加,自身不一定带。建议lncRNA 以DNA 病毒为载体,比如腺病毒和腺相关病毒。
用crispr-cas9技术做knock in实验,插入一个荧光标签蛋白,但最后去看混合克隆荧光的时候,都没有荧光,这要怎么办?
我购买了RNAFit转染试剂,在-20度放了一周还可以用吗?
我想同时敲低两个基因,可以把这两个基因的siRNA加到一个培养基里面吗?
大鼠尾静脉注射跟小鼠相比是不是更容易些?我要注射500ul AAV(腺相关病毒),有什么注意事项吗?
想做启动子转录因子双荧光素酶实验,去找合成公司给我合成启动子,那边说我这个片段很多段发卡结构、GC含量波动很大,合成很难。这可以优化序列吗?
我想筛稳转,之前摸过MOI在50,现在转crispr慢病毒(lintivirus, LV)跟gRNA慢病毒两个病毒的话是都加50还是都减半呀?
转染sirna的时候的时候我用FAM转染试剂摸浓度,最高的那个浓度转染效率有90%,要不要再扩大范围再摸一次浓度啊?
我用siRNA处理细胞,qpcr跑出来结果阴性对照NC组也有敲低效率咋办啊?
想用AAV(腺相关病毒)带特异性启动子来启动诱导细胞死亡的基因,杀死特定细胞,但我查到这个启动子在其他一些细胞上也会发挥作用,所以想用两个特异性启动子联合作用,请问这样可以达到实验目的吗?
做miRNA的过表达,想合成模拟物mimics序列来做,是不是合成目的基因的成熟体序列?还是前体序列也可以合成?
看看有没有收录人源的,一般转录因子的结合位点比较保守,所以也可以选择用人源的转录因子预测。或者是其他网站hTFtarget什么的也有结合位点预测功能。
稳转株可以稳定遗传的,没有固定的代数,构建好的稳转株用嘌呤霉素维持下就可以,直接在培养基中加一定浓度的嘌呤霉素,浓度一般是筛选浓度的一半。实验周期长的话,细胞最好2个月换一批新的。
可以用带转运肽的Gcamp6跟普通Gcamp6,分别带两种不同的荧光,这得转两个载体进去,腺病毒(adenovirus)感觉比较常用。
可以是可以,有文献用siRNA和质粒转染的,但是神经元细胞本身比较难转染,建议还是用病毒做。
请问下,质粒也可以构建稳转株,为什么要用慢病毒做呢?