用于敲低circRNA的干扰序列如何设计?以及circRNA qPCR检测引物如何设计呢?

By momo at 2022-02-24 • 0 人收藏 • 601 人看过
用于敲低circRNA的干扰序列如何设计?以及circRNA qPCR检测引物如何设计呢?
1 个回复 | 最后更新于 2022-02-24
2022-02-25   # 1
circRNA敲低的干扰序列需要在成环接头处设计;qPCR检测引物可以跨接头设计看是否成环,或者一个引物在接头处设计验证精确成环,手动设计qPCR检测引物可以把circRNA序列的3'端100-200bp复制粘贴到其5'端,然后像正常设计线性基因的引物一样,在3'端的这100-200bp上设计正向引物(正向引物可在接头处设计),5'端设计反向引物即可。可以利用网站circRNA Interactome直接进行干扰序列或者qPCR引物设计(https://circinteractome.nia.nih.gov/)

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