用于敲低circRNA的干扰序列如何设计？以及circRNA qPCR检测引物如何设计呢？
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momo
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2022-02-24 •
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用于敲低circRNA的干扰序列如何设计？以及circRNA qPCR检测引物如何设计呢？
1 个回复 |
最后更新于 2022-02-24
lifangtang
2022-02-25
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circRNA敲低的干扰序列需要在成环接头处设计；qPCR检测引物可以跨接头设计看是否成环，或者一个引物在接头处设计验证精确成环，手动设计qPCR检测引物可以把circRNA序列的3'端100-200bp复制粘贴到其5'端，然后像正常设计线性基因的引物一样，在3'端的这100-200bp上设计正向引物（正向引物可在接头处设计），5'端设计反向引物即可。可以利用网站circRNA Interactome直接进行干扰序列或者qPCR引物设计（https://circinteractome.nia.nih.gov/）
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