小恒学术问答
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最后活动于1970-01-01
创建了主题 › 细胞封片要不要甲醛固定
细胞封片要不要甲醛固定
« 2022-08-11
创建了主题 › 如何预测转录因子的结合位点,我这边已经用chip确定了一个小范围
如何预测转录因子的结合位点,我这边已经用chip确定了一个小范围
« 2022-08-11
创建了主题 › AAV 在细胞上的表达远比不上在动物体内的表达,为什么?
AAV 在细胞上的表达远比不上在动物体内的表达,为什么?
« 2022-08-11
创建了主题 › 影响病毒转染效果的因素有哪些?
影响病毒转染效果的因素有哪些?
« 2022-08-11
回复了主题 › 为什么不能用质粒来构建基因稳定表达细胞株呀?
质粒转染细胞进行基因表达,其整合是非同源重组随机整合,几率非常低,且这些转染条 件下发生的整合多发生在转录非活跃区或者重复序列区,导致外源片段表达效率低,同时 这些整合常常不稳定,随着传代次数的增加,即使在有压力选择的情况下也容易发生丢失。
« 2022-08-05
回复了主题 › 慢病毒(lentivirus, LV)、腺病毒(adenovirus, AD)、腺相关病毒(adeno-associated virus, AAV)都可以进行再次扩增吗?
不是所有的都能再次扩增,只有腺病毒可以用293A细胞进行再次扩增,而慢病毒、腺相关病毒都需要进行再次包装,不能进行直接扩增。
« 2022-08-05
回复了主题 › 进行一个基因的过表达,添加 flag 标签的目的是什么呢?
对于带3FLAG标签的蛋白用 Flag 抗体进行蛋白免疫印迹(western blot,WB)检测时,结果会是一条外源表达的条带;如果用目的抗体去检测,结果可能会是两个条带(内源蛋白+外源过表达蛋白),外源过表达条带在内源条带的上方,但是很多时候两条带会在一起形成一条比较粗的条带。
« 2022-08-05
回复了主题 › 我想做小鼠活体成像,可以用荧光蛋白来做吗?
活体成像技术(optical in vivo imaging)目前主要采用生物发光(bioluminescence)与荧光(fluorescence)两种方法。原理:生物发光法是基于荧光素酶能催化底物化学发光的原理,将荧光素酶底物荧光素如 D-Luciferin 等注射入体内进行化学发光反应。荧光发光是通过激发光激发荧光基团到达高能量状态,而后产生发射光,如 EGFP,RFP等。但是由于生物体自发荧光干扰和荧光穿透问题,所以 GFP 等荧光蛋白适合做皮下等浅层组织的活体成像。目前,95%以上的活体实验都是采用荧光素酶 lucifera
« 2022-08-05
回复了主题 › 进行一个基因的过表达,添加 flag 标签的目的是什么呢?
蛋白标签(protein tag)是指利用 DNA 体外重组技术,与目的蛋白一起融合表达的一种多肽或者蛋白质,以便于目的蛋白的表达、检测、示踪和纯化等。比较常用的Flag标签,一般用3FLAG(分子量 2.64kd,一个氨基酸的平均分子量是 0.110KDa)的比较多,主要是方便在 WB 检测表达情况时可以用 Flag抗体去检测外源蛋白过表达的情况,也可以方便的用于蛋白免疫沉淀实验(Immunoprecipitation, IP)。
« 2022-08-05
创建了主题 › T47D细胞培养条件我应该去哪里找?
T47D细胞培养条件我应该去哪里找?
« 2022-08-04
创建了主题 › micRNA 与靶基因预测是怎样来做的?
micRNA 与靶基因预测是怎样来做的?
« 2022-08-04
创建了主题 › 质粒和siRNA一般转染后多久见效,效果维持多久?
质粒和siRNA一般转染后多久见效,效果维持多久?
« 2022-08-04
创建了主题 › AAV需要稀释,用什么稀释后注射动物?
AAV需要稀释,用什么稀释后注射动物?
« 2022-08-04
回复了主题 › 慢病毒感染细胞,使用抗性(比如嘌呤霉素puro)筛选后,后续培养细胞需要继续使用抗性维持培养吗?
仍旧需要使用抗性进行维持培养的,维持培养可以将抗性浓度减半(相对于筛选时的浓度)
« 2022-07-29
回复了主题 › QPCR 实验中 Ct 值偏大(如 Ct 值>30)是为什么?
1)第一个可能是模板量低或基因表达丰度低,建议增加模板量观察Ct 值能否成相应倍数减少。2)第二个可能是 qPCR 整个反应条件不适宜或引物设计不当导致扩增效率低,建议通过标准曲线确认扩增效率。3)第三个可能是扩增产物过长,建议用三步法程序扩增或通过优化引物,扩增产物长度最好不超过 300bp。4)第四个可能是体系中存在抑制剂影响酶的活性,建议梯度稀释模板或重新制备纯度更高的模板。
« 2022-07-29
回复了主题 › 萤火虫荧光素酶Fluc和海肾荧光素酶Rluc与底物反应后,检测波长分别是多少呢?
fluc萤火虫荧光素酶与底物反应后的检测波长是在560nm左右,rluc海肾荧光素酶与底物反应后的检测波长在460nm左右。
« 2022-07-29
回复了主题 › 针对基因编码区CDS设计的干扰序列进行慢病毒包装后做细胞基因干扰,后续进行基因的过表达回补实验要怎么做呀?
后续进行基因过表达回补的话,一般就是在目的基因编码区CDS中针对干扰序列对应的位置进行同义突变再进行回补;如果干扰序列设计在非翻译区(5UTR或3UTR)则过表达回补就不用考虑做同义突变啦,直接过表达野生型编码区CDS序列即可。
« 2022-07-29
创建了主题 › 大鼠的siRNA,同一个基因可不可以用于干扰小鼠?
大鼠的siRNA,同一个基因可不可以用于干扰小鼠?
« 2022-07-28
创建了主题 › Mimics、inhibitor跟agomir、antagomir区别?
Mimics、inhibitor跟agomir、antagomir区别?
« 2022-07-28
创建了主题 › sgrna活性怎么验证?
sgrna活性怎么验证?
« 2022-07-28
创建了主题 › puro浓度预实验是怎么做的?
puro浓度预实验是怎么做的?
« 2022-07-28
回复了主题 › 腺相关病毒(adeno-associated virus,AAV)在体注射感染动物,一般多久开始表达呀,可以维持表达多长时间呢?
这个结合我的经验一般AAV是注射后2周是表达起峰,3周高表达,4周稳定表达;一般在体表达维持时间是3-6个月,也要结合组织的代谢情况具体分析的,实验周期长的话,一般会在一个半月到两个月复注射一次
« 2022-07-22
回复了主题 › Tet-on的慢病毒(lentivirus, LV)感染细胞,一般四环素(doxycycline)加进去多久后开始起效呢?
一般四环素加进去就可以起效,检测RNA或者蛋白表达的话我一般是加入四环素后48-72h检测表达的。
« 2022-07-22
回复了主题 › 过表达和干扰的启动子有什么区别?
过表达用的是 II 型启动子,是依赖 II 型 RNA 聚合酶的启动子,可以启动长的片段,比如 CMV、EF1A ,依赖 PolyA 进行转录终止;干扰用的是 III 型启动子,是依赖Ⅲ型 RNA 聚合酶的启动子,比如 U6,H1启动子,聚合酶Ⅲ遇到连续 4 个或 5 个 T 时,它指导的转录就会终止。
« 2022-07-22
回复了主题 › 用表达gRNA和cas9的质粒做瞬时转染可以达到基因稳定敲除的目的吗?
可以这样做的,cas9和gRNA表达后会对基因组进行编辑,基因组被编辑后就是稳定存在的,之后可以进行单克隆培养,筛选基因敲除单克隆
« 2022-07-22
创建了主题 › OPC ,PAGE ,HPLC 三种纯化方式的siRNA或者 mimic 有什么区别,一般怎么选择?
OPC ,PAGE ,HPLC 三种纯化方式的siRNA或者 mimic 有什么区别,一般怎么选择?
« 2022-07-21
创建了主题 › 在蛋白上添加FLAG等蛋白标签一般带在蛋白的N端还是C端?
在蛋白上添加FLAG等蛋白标签一般带在蛋白的N端还是C端?
« 2022-07-21
创建了主题 › miRNA与靶基因的双荧光素验证能不能在研究的细胞中进行?
miRNA与靶基因的双荧光素验证能不能在研究的细胞中进行?
« 2022-07-21
创建了主题 › EGFP/mCherry 能不能用于活体成像
EGFP/mCherry 能不能用于活体成像
« 2022-07-21
回复了主题 › 某种细胞的慢病毒感染复数MOI的摸索,需要干扰对照病毒和表达干扰靶点的病毒都去做摸索吗?
不需要的,只要用对照病毒摸索出这个细胞合适的MOI就行,我一般用96孔板摸索,节省病毒。
« 2022-03-22