不同物种之间的circRNA同源性该怎么确定？研究人的circ，想再在小鼠研究一下同源的circ。

By MR. 司 at 2020-05-27 • 0 人收藏 • 11635 人看过

2 个回复 | 最后更新于 2020-05-27

MR. 司

2020-05-28 # 1

可以用circ的序列到NCBI上做一个blast试试，看能否找到小鼠的同源性比较好的circ。

2020-05-28 # 2

cirRNA的同源性在人、大鼠、小鼠之间是很差的，这可能是与当前cirRNA还有很多未发现的原因相关，这个同源的cirRNA一般是要借助cirbase里面cirRNA对应的基因，然后去比对同源性

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