我要做融合蛋白，但是不知道标签蛋白是放在N端还是C端，这个有什么建议吗？

一般来说，标签既可以添加在目的蛋白的N端，也可以添加在目的蛋白的C端，但是有几种特殊情况需要考虑：① 对于比较容易降解或者比较难表达的蛋白，蛋白标签可以放在目的蛋白的N端② 目的蛋白的N端如果有信号肽或者N端有特殊结构，标签蛋白需放在目的蛋白的C端；③ 如果目的蛋白的C端内部折叠，标签蛋白放在C端被检测到的可能性比较小，此时标签蛋白需放在目的蛋白的N端；④ 目的蛋白结构未知的情况下，需要将标签蛋白分别构建到目的蛋白的N端和C端，通过实验确定哪个效果更好。